**KATHREEN HUTAYAH**

Minggu, 30 Juni 2013

Bidang-Bidang yang terkalit dalam Bioinformatika


Bidang-bidang yang terkait dengan bioinformatika terutama karena bioinformatika ini merupakan suatu bidang interdisipliner, oleh sebab itu banyak pilihan bagi orang yang ingin lebih lanjut mendalamkan bioinformatika, berikut adalah bidang-bidang yang terkait dengan bioinformatika sebagai berikut :

Biophysics
Sebuah bidang interdisipliner yang mengaplikasikan teknik-teknik dari ilmu fisika untuk memahami struktur dan fungsi biologi.

Computational Biology
Merupakan bagian dari bioinformatika yang paling dekat dengan bidang biologi umum klasik. Bidang ini fokus dalam hal gerak evolusi, populasi, dan biologi molekul.

Medical Informatics
Dalam bidang ini lebih memperhatikan struktur dan algoritma untuk pengolahan data medis dibandingkan dengan data itu sendiri.

Cheminformatics
Bidang bioinformatika yang mengkombinasikan dari sintesis kimia, penyaringan biologis, dan pendekatan data mining yang digunakan untuk penemuan dan pengembangan obat.

Mathematical Biology
Bidang ini menangani masalah-masalah biologi, namun metode yang digunakan untuk menangani masalah tersebut tidak perlu secara numerik dan tidak perlu diimplementasikan dalam software ataupun hardware.

Dari kelima contoh bidang bioinformatika ini, semuanya sangat berperan penting dalam pengembangan dibidang biologi, terutama dalam penemuan dan pengembangan obat, karena di era sekarang banyak penyakit baru yang bermunculan, maka perlu adanya pengembangan obat untuk dapat mengobati penyakit yang baru muncul tersebu

Senin, 03 Juni 2013

Komputasi dan Paralel Processing

Pertanyaan menyangkut komputasi dan paralel processing pada tugas softskill:
1. Buat artikel ttg komputasi & ttng pararel prosessing
2. Jelaskan hubungan antara komputasi modern dg pararel processing
3. Referensi
(contoh perusahaan yang menggunakan konsep paralel processing)



Teknologi Komputasi Awan Semakin Disukai Konsumen TI

Metrotvnews.com, Jakarta: Para pengguna komputasi awan dinyatakan semakin menyukai teknologi yang dipakainya itu.

Demikian disampaikan Chief Executive Officer perusahaan peranti lunak RightScale, Michael Crandell, yang sudah mengikuti perkembangan komputasi awan atau yang populer dengan sebutan cloud sejak satu setengah tahun lalu.

"Dulu, para cendikiawan berkata komputasi awan masih di tahapan remaja. Sedangkan saat ini kita melihat bagaimana komputasi awan kian berkembang dan memasuki tahapan dewasa," ujar Crandell seperti dilansir situs teknologi PCWorld.


Berdasarkan hasil riset perusahaannya, Crandell menemukan fakta bahwa 75 responden dari 600 pekerja teknologi informasi sudah menggunakan komputasi awan untuk berbagai keperluan.

Namun, berbeda dengan perusahaan riset Forrester Research, 70% dari total responden yang merupakan para pengembang disebutkan justru tidak menggunakan komputasi awan sesuai keperluan dalam urusan bisnis mereka.

Menurut Forrester, seperti yang disampaikan analisnya James Staten, masih terlalu dini untuk membuat kesimpulan dari perkembangan komputasi awan. Saat ini komputasi awan masih belum leluasa digunakan dalam kegiatan berbisnis.

"Teknologi semakin dewasa dan lebih cepat berkembang dari kemampuan adaptasi para konsumen. Kita harus menunggu setidaknya lima tahun," pungkas Staten.

Tujuan dari Parallel Processing
salah satu tujuan utama parallel processing, yaitu untuk meningkatkan performa komputer dalam melakukan komputasi. seperti yang sudah dijelaskan diatas. dengan parallel processing waktu yang diperlukan untuk mendapatkan hasil lebih cepat atau hemat waktu dibandingkan dengan pemrosesan data yang hanya menggunakan satu buah processor.

komputasi parallel membutuhkan :
algoritma
Bahasa Pmerograman
Compiler
Komputer yang memiliki satu CPU dapat menghubungkan komputernya dengan komputer yang lain dengan jaringan, namun memerlukan sebuah software yang canggih yaitu distributed processing software.
Hubungan antara Komputasi Modern dengan Paralel Processing


Hubungan antara Komputasi Modern dengan Paralel Processing

Penggunaan Komputer untuk menyelesaikan suatu permasalahan dalam berbagai bidang sekarang ini banyak dilakukan karena lebih  cepat dibandingkan penyelesaian secara manual. Oleh karena hal tersebut, perlu adanya peningkatan proses komputasi yang dapat ditempuh dengan 2 cara, yaitu:

- Peningkatan Kecepatan Hardware : peningkatan kecepatan prosesor komputer dengan menggunakan multiprosesor. Perubahan arsitektur komputer menjadi multiprosesor memang dapat mengerjakan banyak proses dalam 1 waktu, namun tidak dapat mempercapat kinerja proses. Hal ini dapat diatasi dengan peningkatan kecepatan software.

- Peningkatan Kecepatan Software : mencari suatu algoritma untuk mempercepat kinerja proses. Algoritma tersebut tidaklah mudah tuk ditemukan, namun berkat adanya komputer multiprosesor, hal tersebut dapat dirancang dengan memparalelkan proses komputasinya.

Komputer multiprosesor masihlah memerlukan biaya yang cukup besar sehingga menyebabkan beberapa algoritma paralel sulit diimplementasikan. Untuk mengatasinya dirancanglah mesin paralel semu. Mesin paralel semu ini sebenarnya adalah jaringan komputer yang dikendalikan oleh sebuah perangkat lunak yang mampu mengatur pengalokasian proses-proses komputasi kepada processor-processor yang tersebar dalam  jaringan tersebut.

Jadi kesimpulannya, dengan adanya paralel processing mempercepat waktu penyelesaian masalah komputasi karena proses dijalankan secara paralel dg beberapa processor/komputer dengan tujuan/algoritma yang sama. Banyaknya jumlah komputer/prosessor untuk paralel processing, proses komputasi menjadi lebih cepat.



Perusahaan Yang Menggunakan Konsep Komputasi Modern Dan Paralel processing


Komputasi modern terdiri dari dua kata yaitu komputasi dan modern. Komputasi dapat diartikan sebagai cara untuk menemukan pemecahan permasalahan dari data input dengan suatu algoritma. Komputasi merupakan subbagian dari matematika. Selama ribuan tahun, perhitungan dan komputasi menggunakan pena dan kertas, atau kapur dan batu tulis, atau dikerjakan secara mental dan kadang-kadang menggunakan tabel. disebut modern karena menggunakan alat canggih saat menyelesaian masalah. Maka dapat di simpulkan Komputasi modern adalah perhitungan yang menggunakan computer canggih dimana pada computer tersebut tersimpan sejumlah algoritma untuk menyelesaikan masalah perhitungan secara efektif dan efisien.

Komputasi modern digunakan untuk memecahkan masalah antara lain untuk menghitung:
·         Akurasi (bit, floating point)
·         Kecepatan (dalam satuanHz)
·         Problem volume besar (paralel)
·         Modeling (NN dan GA)
·         Kompleksitas (menggunakan Teori Bog O)

Jenis - jenis komputasi modern terbagi tiga, yaitu :
1. Mobile Computing atau Komputasi Bergerak
2. Grid Computing 3. Cloud Computing
Pada kali ini perusahaan yang memakainya contoh google yaitu pada Google Docs adalah aplikasi word processor, spreadsheet, presentasi semacam Microsoft Office, yang berbasis di server. Terintegrasi dengan Google Mail, file tersimpan dan dapat di proses dari internet.




Dan Komputasi Parallel pada GPU....
·                     GPU computing (General Purpose GPU – GPGPU) merupakan konsep pemrograman parallel yang menggunakan GPU sebagai media komputasi untuk memproses komputasi yang umumnya dikerjakan CPU.
·                     Model untuk komputasi GPU adalah dengan menggunakan CPU dan GPU bersama-sama dalam suatu model komputasi heterogen co-processing.
·                     Dari sudut pandang pengguna, aplikasi akan berjalan lebih cepat karena menggunakan kinerja-tinggi dari GPU untuk meningkatkan kinerja.
·                     CPU lebih spesifik menangani permasalahan logika, sedangkan permasalahan komputasi diserahkan kepada GPU.


REFERENSI:
https://www.google.com/search.
www.wikipedia.com
http://cintiia-refleksi.blogspot.com/2013/05/artikel-tentang-komputasi-modern-yang.html
http://dhitovans.blogspot.com/2013/05/artikel-tentang-komputasi-dan-paralel.html
http://adit2602.blogspot.com/2013/05/paralel-processing-komputasi-paralel.html
http://hambalial.blogspot.com/2013/04/website-perusahaan-yang-menggunakan.html
http://3anapoe3.wordpress.com/2013/05/01/artikel-komputasi-modern-mengapa-komputasi-modern-akan-membunuh-penyimpanan-tradisional/